Cơ sở chính của IVAC đóng tại Nha Trang, lấy bộ phận sản xuất vacxin và huyết thanh của Viện Pasteur Nha Trang làm nền tảng. Bộ phận này đã được bác sỹ Alexandre Yersin thành lập năm 1895. Trong một thời gian dài, đây là cơ sở sản xuất vacxin và huyết thanh quan trọng nhất ở Việt Nam. Tổng diện tích mặt bằng của cơ sở Nha Trang là 13.946m2.
Nằm cách Nha Trang 22km về hướng Nam, Trại chăn nuôi Suối Dầu của IVAC đã có lịch sử hơn 100 năm tồn tại và phát triển.
Ngày đó:
Năm 1895, Bác sĩ Alexandre Yersin đến Khánh Hòa để thiết lập cơ sở nghiên cứu khoa học. Tháng 9 năm đó, sau khi xây dựng xong phòng thí nghiệm tại Nha Trang (nay là cơ sở chính của Viện), ông nghĩ đến việc lập trại nuôi ngựa dùng trong việc sản xuất huyết thanh chống dịch hạch. Ban đầu, ông cho ngựa được nuôi ở gần thành Diên Khánh cũ. Tuy nhiên, do nơi đây không có đất trống rộng rãi để lập trại và làm đồng cỏ nên Bác sĩ Yersin đã chọn vùng đất mới tại Suối Dầu.
